source: prextra/lasso.m.org @ 152

Last change on this file since 152 was 5, checked in by bduin, 14 years ago
File size: 1.7 KB
Line 
1function [beta]=lasso(X,Y,lambda)
2% function [beta]=lasso(X,Y,lambda)
3% This function minimize
4% f(beta)=1/N*(Y-X*beta)'*(Y-X*beta)+lambda*sum(abs(beta))
5% with respect to beta.
6%
7% X is a matrix of explanatory variables
8% Y is a vector with the response variables
9% lambda is the weight of the Lagrange factor
10% N is the number of observations
11
12      [n,p]=size(X);     
13      X=X/sqrt(n);
14      Y=Y/sqrt(n);
15      Xtwo=2*X'*X;
16      XY=2*X'*Y;
17
18%% Improvement suggested by Sijmen de Jong
19
20      if(p>n)
21        beta=X'*pinv( X * X') * Y;
22      else
23        beta=pinv(Xtwo)*XY;
24      end
25%%
26      notfound=1;
27
28      while(notfound==1)
29        notzero=find(abs(beta)>1e-5);
30        lnz=length(notzero);
31        therest=setdiff(1:p,notzero);
32        if(length(therest>0))
33          beta(therest)=0;
34        end;
35        if(lnz==0)
36          notfound=0;
37        else
38          g=-XY(notzero)+Xtwo(notzero,notzero)*beta(notzero)+lambda*sign(beta(notzero));
39          Z=sparse(1:lnz,1:lnz,0.5./abs(beta(notzero)),lnz,lnz);
40          if(lnz<n)
41            betastep=(Xtwo(notzero,notzero)+lambda*Z)\g;
42          else
43            Ainv=diag(1./diag(2*lambda*Z));
44            betastep=Ainv*g-Ainv*(2*X(:,notzero)'*((X(:,notzero)*Ainv*2*X(:,notzero)'+eye(n))\(X(:,notzero)*(Ainv*g))));
45          end
46          tempsing=find(betastep==Inf);
47          if((max(isinf(betastep))+max(isnan(betastep)))>0)
48            newbeta=ones(size(tempbeta))*NaN;
49            notfound=0;
50          else                                   
51            newbeta=beta(notzero)-betastep;
52            if(max(abs(betastep))<1E-9)
53              notfound=0;
54            end;
55          end
56          beta(notzero)=newbeta;
57        end
58      end
59
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.